Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms