Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apol7aB2RT54 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apol7aB2RT54 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms