Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms