Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CadB2RQC6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CadB2RQC6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms