Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b5A3FIN4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms