Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms