Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc183A2AJB1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms