Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700023F06RikA2AB62 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms