Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm16A2A935 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm16A2A935 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms