Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul4bA2A432 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul4bA2A432 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms