Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms