Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmpd3A0A140LIW3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms