Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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