Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcniQ9Z2V9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcniQ9Z2V9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcniQ9Z2V9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcniQ9Z2V9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcniQ9Z2V9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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