Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Crlf3Q9Z2L7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crlf3Q9Z2L7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crlf3Q9Z2L7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crlf3Q9Z2L7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crlf3Q9Z2L7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crlf3Q9Z2L7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crlf3Q9Z2L7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Crlf3Q9Z2L7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crlf3Q9Z2L7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crlf3Q9Z2L7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms