Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ilf3Q9Z1X4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ilf3Q9Z1X4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ilf3Q9Z1X4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ilf3Q9Z1X4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ilf3Q9Z1X4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ilf3Q9Z1X4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms