Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Setbp1Q9Z180 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Setbp1Q9Z180 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Setbp1Q9Z180 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Setbp1Q9Z180 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Setbp1Q9Z180 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Setbp1Q9Z180 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Setbp1Q9Z180 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Setbp1Q9Z180 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Setbp1Q9Z180 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Setbp1Q9Z180 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Setbp1Q9Z180 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Setbp1Q9Z180 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Setbp1Q9Z180 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Setbp1Q9Z180 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Setbp1Q9Z180 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Setbp1Q9Z180 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Setbp1Q9Z180 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Setbp1Q9Z180 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Setbp1Q9Z180 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Setbp1Q9Z180 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Setbp1Q9Z180 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Setbp1Q9Z180 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Setbp1Q9Z180 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Setbp1Q9Z180 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Setbp1Q9Z180 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Setbp1Q9Z180 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Setbp1Q9Z180 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Setbp1Q9Z180 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Setbp1Q9Z180 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Setbp1Q9Z180 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Setbp1Q9Z180 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Setbp1Q9Z180 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Setbp1Q9Z180 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Setbp1Q9Z180 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Setbp1Q9Z180 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Setbp1Q9Z180 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Setbp1Q9Z180 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Setbp1Q9Z180 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Setbp1Q9Z180 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Setbp1Q9Z180 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Setbp1Q9Z180 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Setbp1Q9Z180 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Setbp1Q9Z180 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Setbp1Q9Z180 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Setbp1Q9Z180 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Setbp1Q9Z180 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Setbp1Q9Z180 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Setbp1Q9Z180 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Setbp1Q9Z180 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Setbp1Q9Z180 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Setbp1Q9Z180 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Setbp1Q9Z180 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms