Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rspo1Q9Z132 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rspo1Q9Z132 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rspo1Q9Z132 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rspo1Q9Z132 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rspo1Q9Z132 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo1Q9Z132 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rspo1Q9Z132 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rspo1Q9Z132 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rspo1Q9Z132 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rspo1Q9Z132 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rspo1Q9Z132 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms