Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb2Q9R1P3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb2Q9R1P3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb2Q9R1P3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb2Q9R1P3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb2Q9R1P3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms