Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Slit2Q9R1B9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Slit2Q9R1B9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Slit2Q9R1B9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slit2Q9R1B9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Slit2Q9R1B9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Slit2Q9R1B9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Slit2Q9R1B9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Slit2Q9R1B9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Slit2Q9R1B9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Slit2Q9R1B9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Slit2Q9R1B9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Slit2Q9R1B9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Slit2Q9R1B9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Slit2Q9R1B9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slit2Q9R1B9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slit2Q9R1B9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slit2Q9R1B9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slit2Q9R1B9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slit2Q9R1B9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slit2Q9R1B9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slit2Q9R1B9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Slit2Q9R1B9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Slit2Q9R1B9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Slit2Q9R1B9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Slit2Q9R1B9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Slit2Q9R1B9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slit2Q9R1B9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slit2Q9R1B9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Slit2Q9R1B9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Slit2Q9R1B9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slit2Q9R1B9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slit2Q9R1B9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Slit2Q9R1B9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slit2Q9R1B9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slit2Q9R1B9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Slit2Q9R1B9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Slit2Q9R1B9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Slit2Q9R1B9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slit2Q9R1B9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slit2Q9R1B9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Slit2Q9R1B9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slit2Q9R1B9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Slit2Q9R1B9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Slit2Q9R1B9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slit2Q9R1B9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Slit2Q9R1B9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Slit2Q9R1B9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Slit2Q9R1B9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Slit2Q9R1B9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slit2Q9R1B9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Slit2Q9R1B9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Slit2Q9R1B9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms