Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trex2Q9R1A9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trex2Q9R1A9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trex2Q9R1A9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trex2Q9R1A9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trex2Q9R1A9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trex2Q9R1A9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trex2Q9R1A9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trex2Q9R1A9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trex2Q9R1A9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trex2Q9R1A9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trex2Q9R1A9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms