Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn2Q9R0A1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn2Q9R0A1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clcn2Q9R0A1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn2Q9R0A1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn2Q9R0A1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clcn2Q9R0A1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn2Q9R0A1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms