Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsjQ9R014 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CtsjQ9R014 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsjQ9R014 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CtsjQ9R014 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsjQ9R014 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsjQ9R014 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsjQ9R014 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms