Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZN4

Fbxo6, F-box only protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo6Q9QZN4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo6Q9QZN4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo6Q9QZN4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo6Q9QZN4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo6Q9QZN4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo6Q9QZN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo6Q9QZN4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo6Q9QZN4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms