Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30,76■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
Nphp1Q9QY53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Nphp1Q9QY53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Nphp1Q9QY53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Nphp1Q9QY53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Nphp1Q9QY53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Nphp1Q9QY53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nphp1Q9QY53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Nphp1Q9QY53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms