Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdzd4Q9QY39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdzd4Q9QY39 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdzd4Q9QY39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzd4Q9QY39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdzd4Q9QY39 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzd4Q9QY39 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdzd4Q9QY39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzd4Q9QY39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdzd4Q9QY39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdzd4Q9QY39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzd4Q9QY39 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzd4Q9QY39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdzd4Q9QY39 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms