Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnpy2Q9QXT0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnpy2Q9QXT0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnpy2Q9QXT0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnpy2Q9QXT0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnpy2Q9QXT0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnpy2Q9QXT0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnpy2Q9QXT0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cnpy2Q9QXT0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnpy2Q9QXT0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnpy2Q9QXT0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms