Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyhr1Q9QXA1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyhr1Q9QXA1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyhr1Q9QXA1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyhr1Q9QXA1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyhr1Q9QXA1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyhr1Q9QXA1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyhr1Q9QXA1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyhr1Q9QXA1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms