Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AatfQ9JKX4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AatfQ9JKX4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AatfQ9JKX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AatfQ9JKX4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AatfQ9JKX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AatfQ9JKX4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AatfQ9JKX4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AatfQ9JKX4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AatfQ9JKX4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AatfQ9JKX4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AatfQ9JKX4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms