Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc40a1Q9JHI9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc40a1Q9JHI9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc40a1Q9JHI9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc40a1Q9JHI9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc40a1Q9JHI9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc40a1Q9JHI9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc40a1Q9JHI9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.3 ms