Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hipk3Q9ERH7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hipk3Q9ERH7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hipk3Q9ERH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hipk3Q9ERH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hipk3Q9ERH7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hipk3Q9ERH7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk3Q9ERH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hipk3Q9ERH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hipk3Q9ERH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hipk3Q9ERH7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms