Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca3a2Q9EQR4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3a2Q9EQR4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3a2Q9EQR4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3a2Q9EQR4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca3a2Q9EQR4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a2Q9EQR4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clca3a2Q9EQR4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca3a2Q9EQR4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca3a2Q9EQR4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca3a2Q9EQR4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a2Q9EQR4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a2Q9EQR4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a2Q9EQR4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a2Q9EQR4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms