Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Serpina1fQ9DCQ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Serpina1fQ9DCQ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Serpina1fQ9DCQ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Serpina1fQ9DCQ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Serpina1fQ9DCQ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Serpina1fQ9DCQ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Serpina1fQ9DCQ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms