Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc70Q9D9B0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc70Q9D9B0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc70Q9D9B0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc70Q9D9B0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc70Q9D9B0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc70Q9D9B0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc70Q9D9B0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc70Q9D9B0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc70Q9D9B0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc70Q9D9B0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc70Q9D9B0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc70Q9D9B0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc70Q9D9B0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc70Q9D9B0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc70Q9D9B0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc70Q9D9B0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc70Q9D9B0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms