Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn22Q9D7U6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn22Q9D7U6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn22Q9D7U6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn22Q9D7U6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn22Q9D7U6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn22Q9D7U6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn22Q9D7U6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cldn22Q9D7U6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn22Q9D7U6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cldn22Q9D7U6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cldn22Q9D7U6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cldn22Q9D7U6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn22Q9D7U6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms