Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Capns2Q9D7J7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capns2Q9D7J7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capns2Q9D7J7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capns2Q9D7J7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capns2Q9D7J7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capns2Q9D7J7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capns2Q9D7J7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capns2Q9D7J7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capns2Q9D7J7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Capns2Q9D7J7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capns2Q9D7J7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capns2Q9D7J7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capns2Q9D7J7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capns2Q9D7J7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capns2Q9D7J7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms