Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip1Q9D620 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip1Q9D620 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip1Q9D620 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip1Q9D620 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab11fip1Q9D620 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab11fip1Q9D620 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab11fip1Q9D620 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab11fip1Q9D620 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab11fip1Q9D620 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab11fip1Q9D620 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rab11fip1Q9D620 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip1Q9D620 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab11fip1Q9D620 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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