Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4931423N10RikQ9D4J9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
4931423N10RikQ9D4J9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
4931423N10RikQ9D4J9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4931423N10RikQ9D4J9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
4931423N10RikQ9D4J9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4931423N10RikQ9D4J9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms