Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rufy3Q9D394 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rufy3Q9D394 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rufy3Q9D394 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rufy3Q9D394 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rufy3Q9D394 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rufy3Q9D394 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rufy3Q9D394 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rufy3Q9D394 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rufy3Q9D394 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rufy3Q9D394 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rufy3Q9D394 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rufy3Q9D394 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rufy3Q9D394 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rufy3Q9D394 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rufy3Q9D394 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms