Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H9

Mfap4, Microfibril-associated glycoprotein 4, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap4Q9D1H9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfap4Q9D1H9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfap4Q9D1H9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfap4Q9D1H9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfap4Q9D1H9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mfap4Q9D1H9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfap4Q9D1H9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms