Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ss18l2Q9D174 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ss18l2Q9D174 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ss18l2Q9D174 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms