Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpsap1Q9D0M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpsap1Q9D0M1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpsap1Q9D0M1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpsap1Q9D0M1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpsap1Q9D0M1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prpsap1Q9D0M1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpsap1Q9D0M1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpsap1Q9D0M1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms