Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shmt2Q9CZN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Shmt2Q9CZN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shmt2Q9CZN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shmt2Q9CZN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shmt2Q9CZN7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms