Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mrpl55Q9CZ83 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl55Q9CZ83 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl55Q9CZ83 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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