Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmed5Q9CXE7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmed5Q9CXE7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmed5Q9CXE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed5Q9CXE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmed5Q9CXE7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmed5Q9CXE7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms