Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Malsu1Q9CWV0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Malsu1Q9CWV0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Malsu1Q9CWV0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Malsu1Q9CWV0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms