Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gadd45gip1Q9CR59 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gadd45gip1Q9CR59 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45gip1Q9CR59 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gadd45gip1Q9CR59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gadd45gip1Q9CR59 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gadd45gip1Q9CR59 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gadd45gip1Q9CR59 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gadd45gip1Q9CR59 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gadd45gip1Q9CR59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms