Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,89■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Nkiras2Q9CR56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Nkiras2Q9CR56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Nkiras2Q9CR56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Nkiras2Q9CR56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Nkiras2Q9CR56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Nkiras2Q9CR56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Nkiras2Q9CR56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Nkiras2Q9CR56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Nkiras2Q9CR56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Nkiras2Q9CR56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
Nkiras2Q9CR56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Nkiras2Q9CR56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Nkiras2Q9CR56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms