Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY9

Ndufc1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufc1Q9CQY9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufc1Q9CQY9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufc1Q9CQY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufc1Q9CQY9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufc1Q9CQY9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufc1Q9CQY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufc1Q9CQY9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufc1Q9CQY9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufc1Q9CQY9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufc1Q9CQY9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufc1Q9CQY9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufc1Q9CQY9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms