Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SdhbQ9CQA3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SdhbQ9CQA3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SdhbQ9CQA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SdhbQ9CQA3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SdhbQ9CQA3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SdhbQ9CQA3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdhbQ9CQA3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdhbQ9CQA3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdhbQ9CQA3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SdhbQ9CQA3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SdhbQ9CQA3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SdhbQ9CQA3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SdhbQ9CQA3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SdhbQ9CQA3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SdhbQ9CQA3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SdhbQ9CQA3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SdhbQ9CQA3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdhbQ9CQA3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdhbQ9CQA3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SdhbQ9CQA3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SdhbQ9CQA3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SdhbQ9CQA3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SdhbQ9CQA3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdhbQ9CQA3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SdhbQ9CQA3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SdhbQ9CQA3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SdhbQ9CQA3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SdhbQ9CQA3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SdhbQ9CQA3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SdhbQ9CQA3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SdhbQ9CQA3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SdhbQ9CQA3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SdhbQ9CQA3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SdhbQ9CQA3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms